Dealul Kastelli se înalță deasupra moscheei turcești din portul venețian. Acesta a fost locul unde s-a aflat importanta cetate minoică Kydonia, acropolisul vechii Kydonia. Acesta este așezământul original din care provin descoperirile arheologice până acum, dovedind că istoria Chania începe în jurul anilor î.Hr., în perioada neolitică târzie.
Vizitați situl de excavare greco-suedez de la piața Sf. Cathrin, pe strada Kanevaro, care a scos la lumină planul întreg al unei case datând din perioada minoică, părți din alte trei case, precum și străzi înguste și o mică piață. Excavarea arheologică se află la 50 de metri de casa venețiană.
